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DNA分子的柔性性质研究任务书

 2020-04-04 12:46:02  

1. 毕业设计(论文)主要内容:

1. 用分子动力学方法研究DNA分子在受拉情况下的变形。

2. 利用后处理软件分析分子动力学计算结果。

2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1. 阅读dna分子动力学相关文献,查阅相关的文献不少于15篇,其中外文文献不少于10篇,翻译一篇相关的英文资料,原文应不少于20,000英文印刷符;(1-2周)

2. 学习相关分子动力学的理论,学习使用lammps软件;(3-9周) 3. 使用lammps建立dna受拉的分子动力学模型,进而研究dna分子的柔性;(10-13周)

4. 整理计算结果,得到dna分子的持续长度,撰写毕业论文,字数不少于12000字。(14-15周)

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

1. 阅读dna分子动力学相关文献,查阅相关的文献不少于15篇,其中外文文献不少于10篇,翻译一篇相关的英文资料,原文应不少于20,000英文印刷符;(1-2周)

2. 学习相关分子动力学的理论,学习使用lammps软件;(3-9周) 3. 使用lammps建立dna受拉的分子动力学模型,进而研究dna分子的柔性;(10-13周)

4. 整理计算结果,得到dna分子的持续长度,撰写毕业论文,字数不少于12000字。(14-15周)

5. 论文答辩。(16周)

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4. 主要参考文献

[1] 边玉坤, 赵南蓉. 单分子拉伸力实验中dna解链动力学无序效应的介观统计研究. 中国科学:化学 2015:419-26.

[2] 朱杰, 郭连红, 王国栋. dna分子链的初始高度及其压弹性的原子力显微镜研究. 应用力学学报 2008;25:172-6.

[3] pricea c, pilkiewicz k r, tgw g, et al. dna motion capture reveals the mechanicalproperties of dna at the mesoscale[j]. biophysical journal, 2015, 108(10):2532.

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