基于imageJ软件的全扫描组织病理图像分析开题报告
2021-12-11 16:28:11
1. 研究目的与意义及国内外研究现状
由于细胞的形态特征很不一样,即便是同一种细胞,在不同的发展阶段和不同的实验条件下面,它的形态特征也有可能发生变化。
要想对细胞的形态结构进行准确的描述,就要对在不同生理条件下的细胞进行客观的对比,对细胞形态进行定量分析。通过这种统计研究和定量分析,还可以帮助我们找到某些细胞的发展变化的规律。而图像分析技术就是对这类显微图像的定量分析的一种强大的手段,其中,图像分割技术恰恰是进入到图像分析阶段的前提,为接下来的图像分析提供依据。
国内外研究现状
基于边界的分割方法的原理是利用不同区域间象素灰度不连续的特点来检测出区域间的边缘,以此来实现对于图像的分割。有很多种确定图像边界的方法,我们可以进行归类分为以下两大类:基于模型的方法和基于几何边界追踪的方法。对于基于模型的方法来说,因为不同的给出模型方法,我们可以将基于模型的方法分为活动轮廓模型和参数模型两种类型。活动轮廓模型是指在内力和外力共同作用于物体的情况下,把物体的边界看作为持续变化最后达到平衡状态的一种过程。另外一种更加普遍的的方法是利用在边界处物体的能量处于最小的状态的的原理来寻找边界,最终得到的曲线就如同一条蛇一样移动,因此我们将这种模型称作为“蛇线”(snake)模型。可变模型的突出优点是能够生成连续光滑的参数曲线或者是连续光滑的参数曲面。可变模型的缺点则是指在蛇线的初始化阶段,初始参数需要由操作者亲自提出,无法自动获得。初始化自动蛇线模型的研究是现在科学研究方向的一个比较热门的研究点,有着良好的研究前景。参数模型方法的原理是利用参数来表现待分割的图像模型。图像模型在一个特定的条件的控制下会改变模型的形状,并且改变后的形状与实际的结构更加相近。目前使用最多的模型是血管图像分割中的椭圆模型,血管模型的参数依据血管图像的估计给定。
2. 研究的基本内容
本文的主要内容及创新之处:
使用imagej软件对细胞全扫描图像进行阈值和二值化处理,解决matlab无法对如此大图像操作的窘境。
本文主要有几个部分,每个部分具体内容分别如下:
3. 实施方案、进度安排及预期效果
实施方案:在本文中我将先通过imagej软件打开全扫描图像,然后通过彩色图像阈值处理找出细胞图像的细胞区域,然后对其进行二值化处理,最后结合深度学习的方法找出质心并且展示最终结果。
进度安排:(1)2016年3月25号之前准备阶段,相关资料的搜寻;
(2)2016年4月10号之前任务书和开题报告的撰写;
4. 参考文献
[1] 宋百锋,郑传城,郭根武,苏锋,文万信. imagej在临床肿瘤体积计算中的应用[j]. 中国辐射卫生. 2009(04)
[2] 宋玉丹,秦志钰,容幸福. 用imagej提取图像边缘的方法及展望[j]. 机械管理开发. 2009(s1) .
[3] 宋玉丹,容幸福,秦志钰. 利用imagej提取目标物平面图像外轮廓的方法[j]. 中国高新技术企业. 2008(01) .