文 献 综 述 1.1β折叠二级结构研究 Lifson和Sander[1]首次研究了平行β折叠和反平行β折叠的氨基酸配对作用，指出相反电荷的氨基酸之间、具有支链的氨基酸（异亮氮酸、亮氨酸、缬氨酸）之间、以及侧链可以形成氢键的氨基酸之间容易产生相互作用。

然而，当时仅有30个已知结构的蛋白质样本，并且也只能按氨基酸的化学性质来给氨基酸分类。

1995年，Wouters和Curmi[2]利用253个已知结构的蛋白质样本分析了反平行β折叠结构中的氨基酸配对，结果表明相反电荷的氨基酸之间、含芳香环的氨基酸之间以及侧链可以形成氢键的氨基酸之间表现出明显的相互作用。

后来，Hutchinson[3]用311个蛋白质样本做了更详尽的反平行折叠的氨基酸配对研究，并分析了氨基酸的立体化学参数，发现在不形成股问氢键的位置上，支链氨基酸或带芳香环的氨基酸容易形成配对；在形成股间氢键的位置则相反，因为氢键阻碍了氨基酸取更多的侧链构象。

他们还发现反平行折叠中氨基酸的配对偏好受周围氨基酸的影响很小，有偏好的相对独立性。

Merkel等[4]通过实验的方法分析了平行β折叠中的跨股氨基酸配对能量。

Fook等[5]结合立体化学的方法系统研究了平行β折叠中的氨基酸配对偏好。

另外一些研究[6,7]也发现氢键位和非氢键位上的氨基酸配对偏好有明显差异。

在数据整理方面，Dou等分析了链间Β折叠的相互作用，建立了链间β折叠数据库[8]。

从上个世纪以来，人们对平行和反平行的β折叠做了一些传统的计算生物学研究，然而，当时由于已知结构的蛋白质数据非常稀少，其所用数据集和提出的方法都十分局限，难以适应目前出现的新的海量蛋白质数据。