1. 研究目的与意义（文献综述包含参考文献）

文 献 综 述 1、 研究背景： 生物序列一般指dna、rna序列或蛋白质序列，对它们的研究是近代生命科学中研究中的一个关键而又基本的问题，大量生命现象的奥秘蕴含在其中。

对生物序列进行比对，可以在核酸、氨基酸的层次上对生物序列的相似性进行分析，从而推测比对中的各个序列间结构功能以及进化上的联系。

通过对各种不同类型的生物序列进行比对，可以寻找与确定比对序列的稳定区域与变化规则，发现它们的功能特征和区别，还可以检测新序列与数据库中已知序列的相似性关系（结构和功能），从而为确定新序列的结构和功能信息提供事实根据。

2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

问题一：建立基于 20 种氨基酸的功率谱 研究途径： 对一个长度为 n 的蛋白质序列 ，序列 属于一个有限的符号集合， ，其中 为 20 种氨基酸中的一种，建立符号序列s 中 的指示函数。

通过指示函数得到 20 个长度为 n 的二进制数列设为 ，那么符号序列 可以 表示为 记 。

对蛋白质 序列进行离散傅里叶变换，得 。