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基于Web技术的蛋白质复合物识别系统的设计与实现任务书

 2020-04-09 15:20:56  

1. 毕业设计(论文)主要内容:

蛋白质复合物在细胞生命活动中发挥着非常重要的功能,然而传统的化学实验检测方法存在着实验成本昂贵以及所识别的复合物覆盖率低等问题,严重地制约了蛋白质复合物相关应用研究的进一步发展。本次毕业设计的主要内容是基于已发表的蛋白质复合物识别算法来设计和实现在线蛋白质复合物识别系统,并通过互联网向相关科研人员开放。系统实现的主要功能包括蛋白质相互作用网络数据上传,算法运行以及结果可视化等功能。对于数据挖掘和生物信息相关研究感兴趣的同学可以选择此设计课题。

2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1.查阅15篇相关文献(含2篇外文),并每篇书写200—300字文献摘要(装订成册,带封面);
2.认真填写周记,完成800字开题报告;
3.完成5000中文字以上的相关英文专业文献翻译,并装订成册(中英文一起,带封面);
4.完成系统的编码与调试;
5.完成10000字以上的毕业论文;
6.进行论文答辩。


3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

(1)2018/1/14—2018/3/5:确定选题,查阅文献,外文翻译和撰写开题报告;
(2)2018/3/6—2018/4/30:系统架构、程序设计与开发、系统测试与完善;
(3)2018/5/1—2018/5/25:撰写及修改毕业论文;
(4)2018/5/26—2018/6/6:准备答辩。


4. 主要参考文献

[1] hu, lun, and keith cc chan. "a density-based clusteringapproach for identifying overlapping protein complexes with functionalpreferences." bmc bioinformatics 16, no. 1 (2015): 174.

[2] spirin, victor, and leonid a. mirny."protein complexes and functional modules in molecular networks." proceedings of the nationalacademy of sciences 100, no. 21(2003): 12123-12128.

[3] 鱼亮, 高琳, 孙鹏岗. "蛋白质网络中复合体和功能模块预测算法研究." 计算机学报 34, no. 7(2011): 1239-1251.

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