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金坛中华绒鳌蟹养殖区抗生素抗性基因的高通量测序初步研究开题报告

 2021-12-23 21:31:31  

全文总字数:3293字

1. 研究目的与意义及国内外研究现状

抗生素不仅能防治细菌性疾病,还发挥着促进养殖生物生长的重要作用。近年来,抗生素在水产养殖中被广泛使用并发挥着无可替代的作用,但长期滥用抗生素导致水生动物体内产生携带抗性基因的菌株,特别是多重耐药性菌株,造成了愈发严重的抗性基因污染问题,为各种疾病的临床治疗带来巨大的挑战。

在水产养殖中,大量抗性细菌和抗性基因随动物粪便直接排放到养殖区水生生态环境中,作为新型的污染物,抗生素抗性基因在环境中迁移传播,最终可能会通过食物链进入人体内,对人类健康构成严重的威胁。现如今,人们对蟹的需求量越来越大,金坛中华绒螯蟹更是广受青睐。因此,研究抗生素抗性基因在其养殖区水生态系统中的分布和污染水平显得尤为重要。

宏基因组学是描述一个群落的遗传潜力、识别群落中微生物的存在类型和负责抗生素耐药性的基因或遗传变异存不存在的有力工具。基于高通量测序技术的宏基因组学通过对从环境中提取的dna样品进行测序,并将该样品假定为整个群落的随机部分,然后将所测序列与已在国内和国际数据库中积累的已知序列(参考序列)进行比较,以鉴定已知导致耐药性的抗性基因或突变。高通量测序技术具有成本低、通量高、可以快速产生大量数据等特点,是目前应用最为广泛的测序技术。

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2. 研究的基本内容

1)、中华绒螯蟹养殖区水样及沉积物样品采集

2)、水样中抗生素抗性基因的高通量测序研究

3)、沉积物样品中抗生素抗性基因的高通量测序研究

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3. 实施方案、进度安排及预期效果

实行方案:

1)、采集样品

2)、测定水样的理化性质,如总氮、总磷、codmn

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4. 参考文献

[1]schmieder r, edword r. insights into antibiotic resistance through metagenomic approaches, future microbiol., 2012, 7(1): 73-89.

[2]chen b, yuan k, chen x, et al. metagenomic analysis revealing antibiotic resistance genes (args) and their genetic compartments in the tibetan environment[j]. environmental science technology, 2016, 50(13).

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