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毕业论文网 > 任务书 > 化学化工与生命科学类 > 化学工程与工艺 > 正文

基于分子动力学模拟方法研究多肽rrlif对CDK2/CDK4的选择性机理任务书

 2020-06-10 22:43:03  

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

(1)通过查阅文献,了解该课题的国内外研究现状;

(2)学习和掌握有关计算软件的使用;

(3)选择对于这两种激酶具有选择性的多肽抑制剂为研究体系,利用amber软件对体系进行模拟计算,分析体系在溶剂中的构象变化;

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2. 参考文献

[1] premnath p n, craig s n, liu s, et al. iterative conversion of cyclin binding groove peptides into druglike cdk inhibitors with antitumor activity [j]. j med chem, 2015, 58(1): 433-442.

[2] kontopidis g, andrews m j, mcinnes c, et al. truncation and optimisation of peptide inhibitors of cyclin-dependent kinase 2-cyclin a through structure-guided design [j]. chemmedchem, 2009, 4(7): 1120-1128.

[3] dai l, liu y, liu j, et al. a novel cycline/cyclina-cdk inhibitor targets p27(kip1) degradation, cell cycle progression and cell survival: implications in cancer therapy [j]. cancer letters, 2013, 333(1): 103-112.

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3. 毕业设计(论文)进程安排

起讫日期

设计(论文)各阶段工作内容

备 注

2017-02-25~2017-03-25

系统地检索和阅读相关中外文文献,了解该课题的国内外研究现状。对CDK2和CDK4的结构和性质,作图软件Pymol、Origin,计算机模拟软件Amber 10,前人的研究等有所了解,完成开题报告。

2017-03-25~2017-05-10

进一步学习和掌握有关计算软件的使用,用Amber 10对结合态和游离态结构进行MD模拟,最后用MM/PBSA进行能量分析。

2017-05-10~2017-06-11

对计算结果进行分析和总结,完成毕业论文,并为答辩做准备。

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