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毕业论文网 > 任务书 > 化学化工与生命科学类 > 生物技术 > 正文

土壤环境菌群的16sRNA扩增技术研究任务书

 2020-04-13 17:07:41  

1. 毕业设计(论文)主要内容:

16S rDNA鉴定是指用利用细菌16S rDNA序列测序的方法对细菌进行种属鉴定。包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。是一种快速获得细菌种属信息的方法。细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16S和23S rRNA。16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中。16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟,其种类少,含量大(约占细菌RNA含量的80%),分子大小适中,存在于所有的生物中,其进化具有良好的时钟性质,在结构与功能上具有高度的保守性,素有“细菌化石”之称。在大多数原核生物中rDNA都具有多个拷贝,5S、16S、23S rDNA的拷贝数相同。16S rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。本课题将从土壤环境中获得菌群样品,提取菌群总DNA,利用特异引物扩增16SrDNA的特定序列,为高通量测序奠定基础。

2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

[1] 查阅不少于15篇相关资料,英文文献不少于2篇,完成开题报告。

[2] 提取菌群总dna,利用特异引物扩增16srdna的特定序列。

[3] 完成不少于20000字符的英文文献翻译。

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

[1] 第1周:了解论文题目,认识所需完成的主要内容和任务;搜集相关学术期刊、论文、文稿、专利、教材等资料,阅读后进行总结,对论题形成一个初步的系统性的认识。

[2] 第2-3 周:完成毕业论文开题报告,确定实验技术路线,确定具体的实验方案和步骤。

[3] 第4-8周:提取菌群总dna,利用特异引物扩增16srdna的特定序列。

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4. 主要参考文献

[1] 毛伟华, 吴三玲, 张旭 (2015) 土壤微生物16S rDNA的Ion Torrent PGM高通量检测方法构建与应用, 浙江农业学报, 12: 2165-2170

[2] 朱诗应, 戚中田. (2013) 16S rDNA扩增及测序在细菌鉴定与分类中的应用, 微生物与感染, 2: 104-109

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